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普通pcr與熒光定量pcr引物設(shè)計(jì)比較

普通pcr引物設(shè)計(jì)和熒光定量pcr引物設(shè)計(jì)的區(qū)別

一、方法不同


1、普通pcr引物設(shè)計(jì):引物的優(yōu)劣直接關(guān)系到PCR的特異性與成功與否。


2、熒光定量pcr引物設(shè)計(jì):通過熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性探針,標(biāo)記跟蹤PCR產(chǎn)物進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)反應(yīng),利用與之相適應(yīng)的軟件對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行分析,計(jì)算待測(cè)樣品模板的初始濃度。

二、原理不同

1、普通pcr引物設(shè)計(jì):為了找到一對(duì)合適的核苷酸片段,使其能有效地?cái)U(kuò)增模板DNA序列。

2、熒光定量pcr引物設(shè)計(jì):在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),通過熒光信號(hào)不斷累積而實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR全程,然后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。在實(shí)時(shí)熒光定量PCR中,對(duì)全程PCR擴(kuò)增過程進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè),根據(jù)反應(yīng)時(shí)間和熒光信號(hào)的變化可以繪制成一條曲線。

三、注意事項(xiàng)不同

1、普通pcr引物設(shè)計(jì):引物應(yīng)用核酸系列保守區(qū)內(nèi)設(shè)計(jì)并具有特異性。產(chǎn)物不能形成二級(jí)結(jié)構(gòu)。引物長(zhǎng)度在15~30堿基之間。

1、熒光定量pcr引物設(shè)計(jì):實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 儀應(yīng)安放在濕度較低、灰塵較少、遠(yuǎn)離水池的平穩(wěn)臺(tái)面上,不能有強(qiáng)光直射,室內(nèi)應(yīng)通風(fēng)良好,無腐蝕性氣體 。